"Som jag ser det har myntet två sidor. På vissa sätt har den illegala nedladdningen hjälpt oss, absolut, särskilt när det kommer till popularitet och igenkänning", säger Gilligan till BBC.
"Men baksidan är att massor av människor som jobbat med serien förlorat pengar, jag själv inkluderad, som vi skulle ha tjänat om alla nedladdningar varit lagliga."
Efter finalavsnittet av "Breaking Bad" sänts i USA den 29 september laddades det ned 500 000 gånger under de första tolv timmarna det låg ute på piratsajter. Detta enligt sajten TorrentFreak.com.
"Piratkopieringen är till syvende og sidst ett problem och kommer att fortsätta vara det även framöver", säger Gilligan. För vi behöver alla äta. Och vi behöver alla få betalt.