E Online skriver att dokumentären ska följa några av mässdeltagarna i tre månader fram tills att den anordnas och sedan filma dem på plats.
På Comic-Con fordas hyllas både serieböcker, kultfilmer och filmmänniskor.
Spurlock har tidigare gjort den hyllade dokumentären "Super Size Me" medan Whedon är känd för "Buffy och vampyrerna" och "Firefly".